Résumé
We report a comprehensive molecular characterization of pheochromocytomas and paragangliomas (PCCs/PGLs), a rare tumor type. Multi-platform integration revealed that PCCs/PGLs are driven by diverse alterations affecting multiple genes and pathways. Pathogenic germline mutations occurred in eight PCC/PGL susceptibility genes. We identified CSDE1 as a somatically mutated driver gene, complementing four known drivers (HRAS, RET, EPAS1, and NF1). We also discovered fusion genes in PCCs/PGLs, involving MAML3, BRAF, NGFR, and NF1. Integrated analysis classified PCCs/PGLs into four molecularly defined groups: a kinase signaling subtype, a pseudohypoxia subtype, a Wnt-altered subtype, driven by MAML3 and CSDE1, and a cortical admixture subtype. Correlates of metastatic PCCs/PGLs included the MAML3 fusion gene. This integrated molecular characterization provides a comprehensive foundation for developing PCC/PGL precision medicine.
langue originale | Anglais |
---|---|
Pages (de - à) | 181-193 |
Nombre de pages | 13 |
journal | Cancer Cell |
Volume | 31 |
Numéro de publication | 2 |
Les DOIs | |
état | Publié - 13 févr. 2017 |
Modification externe | Oui |
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Dans: Cancer Cell, Vol 31, Numéro 2, 13.02.2017, p. 181-193.
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T1 - Comprehensive Molecular Characterization of Pheochromocytoma and Paraganglioma
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N1 - Publisher Copyright: © 2017 Elsevier Inc.
PY - 2017/2/13
Y1 - 2017/2/13
N2 - We report a comprehensive molecular characterization of pheochromocytomas and paragangliomas (PCCs/PGLs), a rare tumor type. Multi-platform integration revealed that PCCs/PGLs are driven by diverse alterations affecting multiple genes and pathways. Pathogenic germline mutations occurred in eight PCC/PGL susceptibility genes. We identified CSDE1 as a somatically mutated driver gene, complementing four known drivers (HRAS, RET, EPAS1, and NF1). We also discovered fusion genes in PCCs/PGLs, involving MAML3, BRAF, NGFR, and NF1. Integrated analysis classified PCCs/PGLs into four molecularly defined groups: a kinase signaling subtype, a pseudohypoxia subtype, a Wnt-altered subtype, driven by MAML3 and CSDE1, and a cortical admixture subtype. Correlates of metastatic PCCs/PGLs included the MAML3 fusion gene. This integrated molecular characterization provides a comprehensive foundation for developing PCC/PGL precision medicine.
AB - We report a comprehensive molecular characterization of pheochromocytomas and paragangliomas (PCCs/PGLs), a rare tumor type. Multi-platform integration revealed that PCCs/PGLs are driven by diverse alterations affecting multiple genes and pathways. Pathogenic germline mutations occurred in eight PCC/PGL susceptibility genes. We identified CSDE1 as a somatically mutated driver gene, complementing four known drivers (HRAS, RET, EPAS1, and NF1). We also discovered fusion genes in PCCs/PGLs, involving MAML3, BRAF, NGFR, and NF1. Integrated analysis classified PCCs/PGLs into four molecularly defined groups: a kinase signaling subtype, a pseudohypoxia subtype, a Wnt-altered subtype, driven by MAML3 and CSDE1, and a cortical admixture subtype. Correlates of metastatic PCCs/PGLs included the MAML3 fusion gene. This integrated molecular characterization provides a comprehensive foundation for developing PCC/PGL precision medicine.
KW - CSDE1
KW - MAML3
KW - TCGA
KW - expression subtypes
KW - genomics
KW - metastasis
KW - molecular profiling
KW - paraganglioma
KW - pheochromocytoma
KW - sequencing
UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=85011305911&partnerID=8YFLogxK
U2 - 10.1016/j.ccell.2017.01.001
DO - 10.1016/j.ccell.2017.01.001
M3 - Article
C2 - 28162975
AN - SCOPUS:85011305911
SN - 1535-6108
VL - 31
SP - 181
EP - 193
JO - Cancer Cell
JF - Cancer Cell
IS - 2
ER -